兰大一院心血管外科专业始建于1955年，尹良培教授率先开展了西北首例心脏二尖瓣分离手术，并作为先进工作者受到了毛主席的接见。目前该科是“甘肃省首批省级重点专科”、“全国青年文明号”、“国际儿童心连心组织中国合作单位”、“德国柏林心脏中心甘肃省合作单位”、美国小红巾联盟定点合作单位、“美国波士顿儿童医院国际先心病质量改进协作单位”。是甘肃省规模最大、结构最全、实力最强的心脏外科中心，年手术量超过1000例，手术种类、数量、质量均居全省首位，跻身全国先进行列。

科室拥有2个病区共65张床（普通病房45张和监护病房20张）及5个专业组（外科组、麻醉组、体外循环组、术后监护组、超声组），建立了与国际接轨的心脏外科中心独立运转模式，建成了一套集筛查、诊断、手术、术后恢复、出院随访，“五位一体”的医疗服务体系。该科室率先在省内实施新生儿大动脉调转术、完全型肺静脉异位引流矫治术、经导管途径主动脉瓣置换术（TAVR手术）、心内直视手术同期行改良迷宫手术治疗房颤、先心病伞堵术、全胸腔镜下心脏手术、体外膜肺氧合（ECMO）技术等，多项新技术填补了省内空白。目前能常规进行各类普通先天性心脏病矫治手术（包括经外周血管途径或外科途径先心病封堵术、右侧腋下小切口或胸腔镜下或常规正中开胸先心病矫治术等）；复杂型先天性心脏病矫治手术（包括法洛氏四联症、右室双出口、三尖瓣下移畸形、肺静脉异位引流、主动脉弓缩窄、主动脉弓中断等）；心脏瓣膜置换、瓣膜成形手术（包括经胸腔镜下、胸骨上段小切口等微创手段）；各类大血管手术（包括Bentall、Wheat,s、David、全主动脉弓置换+象鼻支架植入、主动脉覆膜支架腔内隔绝、腹主动脉瘤切除人工血管置换等）、冠状动脉搭桥手术（包括胸骨旁小切口微创手段）等。

此外，该科室是“爱佑慈善基金”、“美国小红巾慈善基金”、“红十字会天使阳光基金”等多家慈善基金组织合作单位，每年资助数百名先心病患儿，为广大贫困先心病患者解决了经济困难。